种业是渔业发展的基础“芯片”，对推动养殖业高质量发展、加快现代化海洋渔业建设具有重要作用。

作为鱼类生物技术专家，中国工程院院士、中国水产科学研究院黄海水产研究所研究员陈松林潜心研究水产生物技术30年，致力于为我国渔业培育突破性新品种提供技术支撑。

2009年，陈松林院士带领中国水产科学研究院黄海水产研究所团队与华大集团开启合作，依托基因组技术探索鱼类研究领域的重要科学问题，助推我国鱼类种业的科技进步和水产养殖业的高质量发展。

自合作以来，双方共同完成了半滑舌鳎、牙鲆、斑石鲷等物种的基因组测序与相关研究工作，其中，陈松林院士团队建立的半滑舌鳎分子标记辅助性控技术和新品种“鳎优1号”，正在我国沿海地区推广应用，其带来的经济和社会效益超70亿元。

今天，我们有幸邀请到了陈松林院士。一起听听他对渔业研究、种业发展以及与华大合作的看法吧！

问：近年来，您带领团队与华大合作完成半滑舌鳎、牙鲆全基因组测序等项目，请问您最初选择与华大开展合作的契机是什么呢？

陈松林：鱼类遗传育种和养殖产业中存在一些难题，通过传统方法难以解决。以半滑舌鳎为例，它是一种比目鱼类，最大的特点是雌雄鱼相差很大。经过两年养殖后的雌鱼能长到两斤，而雄鱼还不到半斤。而在普通苗种中，雄鱼的比例高达80%，因此其生长慢、个体小这个问题就严重限制了产业的发展。限制雄鱼长大的原因是否和它的基因有关？如何才能让它长大？这些科学问题和产业问题都是传统方法难以解决的，于是我们就想通过基因组测序来寻找决定半滑舌鳎性别和大小的关键基因。

鉴于此，我们在2009年选择和华大合作开展相关研究，当时华大在动植物基因组测序方面已经崭露头角，取得了一些重要的成果。我们双方一起组建了一支国际合作研究团队，第二年顺利完成了半滑舌鳎的全基因组测序工作。后面经过三年时间的共同努力，发现了半滑舌鳎的性别决定基因，建立了遗传性别鉴定技术和高雌苗种制种技术，解决了养殖产业中雄鱼比例过高的问题。2014年1月，半滑舌鳎基因组研究成果发表于《自然·遗传学》。这是我们国家完成并发表的第一个鱼类基因组测序成果，也是世界上首个发表的比目鱼基因组序列。

问：自半滑舌鳎基因组测序后，我国在鱼类基因组解析上取得了哪些重要突破？

陈松林：基因资源是战略性资源，谁抓住了基因资源，谁就抢占了种业的高地。国外团队从上世纪90年代起就开展了鱼类基因组测序的研究，比如新加坡科学家在国际上率先完成了红鳍东方鲀的全基因组测序，成果于2002年在《科学》上发表。

2014年首个比目鱼基因组研究成果的发布，极大促进了我国鱼类基因组序列破译的进程。目前，我国已完成全基因组测序并发表的养殖鱼类共有50余种。以黄海所为例，近几年来，基于全基因组序列的破译和现代基因组选择技术的建立，我们相继培育了牙鲆“鲆优2号”、半滑舌鳎“鳎优1号”等抗病高产的新品种。

问：如何看待全基因组测序对鱼类种业发展的推动作用？

陈松林：经过30多年的发展，我国的水产养殖业及水产种业取得了一系列进展，比如截至今天，我国共审定了283个水产新品种。这些新品种大多采用了传统的培育方法，主要性状改良是生长速度变快了，但所需的培育周期较长，也很少有同时具备抗病、高产的优质新品种。

破译全基因组序列的重要性首先体现在，很多以前不能回答的科学问题，比如性别决定机制、变态分子机制、肌间刺发育机制、抗病性状的调控机制等等，现在通过基因组测序可以回答了，基因组测序推动了水产基础研究的进程，提高了水产基础研究的水平。

此外，基因组解析能够为培育抗病、抗逆、高产等突破性新品种提供基因资源，帮助建立全基因组选择育种技术等新的技术手段。通过和基因组选择技术、基因编辑技术的结合，也将创造出很多创新性的新品种，这是以往采用传统育种技术所不能实现的。

所以说，全基因组测序能够为鱼类遗传改良、良种选育提供重要的基因资源，为育种技术的创新奠定基础，对推动我国水产种业和养殖业的发展具有重要的意义。

问：可否谈谈您对与华大未来进一步合作的期待？

陈松林：过去20多年时间里，华大在推动基因组解析和我国基因组学科发展等方面发挥了重要作用。通过率先主导或者和其他单位合作的方式，华大破译了很多重要物种的基因组，是我们国家从事基因组研究的一个领头军。

每次项目开展期间，我们团队的同事也会到深圳，和华大研究院的伙伴进行及时的交流，分析基因组组装数据，讨论拟回答的科学问题。在合作过程中，我们也体会到华大在基因组测序、组装、生物信息分析等方面具有很强的实力，期待今后我们在单细胞以及泛基因组等前沿领域进一步开展合作，共同产出更多创新性成果。