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GigaScience创刊10周年丨以开放科学为前提,改变科学出版的方式

发布日期:2022/08/02

GigaScience是华大集团旗下出版部门GigaScience出版社出版的科学杂志,也是一种以全新的“集成出版”模式运营的开放获取期刊。今年,是GigaScience创刊十周年。

我们团队的目标是改变科学出版的方式”,GigaScience出版社社长Laurie Goodman博士介绍道,“除了在20世纪90年代将科学期刊转移到网络上之外,近350多年来,科学研究出版几乎未发生什么变化,我们决定去改变这种情况。”

GigaScience出版社成员在亚洲演化生物学大会合影(2018年)

GigaScience的文章侧重于“组学、成像和其他高通量生物学”,其数据目前存储在公共数据库中,并且还涵盖了一些数据类型较难访问的研究,如影像学、神经科学、生态学和网络数据,以及系统生物学和其他新的大数据类型。

通过GigaScience出版社建立的大型数据库GigaDB,读者不仅可以阅读成果,也可以获取研究人员使用的所有数据和工具。这种创新方法允许阅览者使用原始数据和准确的方法来验证,进而增加结果的可信度。同时,研究人员也可以根据提供的信息开展自己的研究。出版社使用科学数据管理的公平性原则来管理这些资源,该原则规定了研究数据是可查找、可访问、可互操作和可重复使用的。

出版社还建立了GigaGalaxy.net——一个基于Galaxy的数据分析平台,其能存储计算方法和工作流,以便最大限度地利用论文中的数据。

GigaScience出版社的其他重大贡献,还包括对预印文本与protocols.io平台的整合,以及对这种鼓励公开透明、合同协作的全新模式的推广。GigaScience出版社与其他出版社一同为21世纪出版行业的框架建立做出了突出贡献,在遵守数据发行通则和开放科学原则的基础上,引领整个出版业不断进步。

GigaScience出版社于2016年加入牛津大学期刊出版项目,2018年,美国出版协会因GigaScience在多学科期刊出版方面的创新,授予其“期刊出版创新奖”(PROSE奖)。Laurie在解释获奖原因时称:“我们一直尝试将大家在纸上或网上可阅读的静态文章变为动态的交互过程”。同时,GigaScience出版社不像传统期刊一次性的提交,而是允许研究人员使用新的结果和数据不断更新自己的研究。

GigaScience出版社的另一本期刊GigaByte于2020年推出,这是一本旨在于正式同行评议出版平台下促进科学信息快速交流的期刊。GigaByte鼓励研究人员分享他们正在进行中的研究,这些研究结果可立即为科学界提供有用的帮助。它支持数据和软件可视化的交互功能,包括交互式小部件、编码插件、嵌入式视频剪辑、可视化、以及用于三维打印的蓝图下载等。

GigaScience出版社成员在亚洲演化生物学大会合影(2018年)

GigaByte的新成果得到了业界的广泛认可。2022年,GigaByte入围“2022年学术与专业学会出版商协会(ALPSP)出版创新奖”,获胜者将于9月16日在英国曼彻斯特的ALPSP大会上揭晓。

GigaScience出版社在影响科学期刊出版业的同时,也毫不动摇地坚守着全球公认的科学研究、版权和出版协议。GigaScience是出版伦理委员会(COPE)的现任会员,作为COPE研究数据出版伦理工作组的一员,其已起草了与研究数据出版有关的道德问题及处理建议和清单。

截至2022年7月,来自86个国家的1957家机构,共计7198名作者已在GigaScience发表了1021篇论文。GigaDB.org已发表了67TB的数据、2195个数据集和347185个文件,且这些数字还在快速地上升。

因为出版平台的成本节约性和独特性,2022年5月GigaScience发表了一系列由世界卫生组织赞助的数据论文,分享了来自媒介传播的病原体极其重要的公共卫生数据集。文章中生物多样性的数据为研究人员提供了信息,有助于他们应对这一造成了超过17%传染病的紧迫的公共卫生问题。

GigaScience主编Scott Edmunds博士说:“这是所有人共同努力的成果,不止是GigaScience出版社员工,还有全球科学界的很多研究人员和支持者,对此我们真诚地表示感谢。”

牛津大学出版社开放存取出版总监Rhodri Jackson对GigaScience十周年表示祝贺:GigaScience是一本真正具有创新性的杂志,我们非常感谢能与贵出版社及编辑们合作,期待下一个十年!”

在开放科学前沿耕耘了十年之后,2021年底,《联合国教科文组织开放科学建议书》的出版和批准极大地推动了这些实践。这表明开放科学已成为主流,它证实了过去的努力并强调了未来道路上仍需做的事情。GigaScience在十岁生日当天发表了一篇社论,将他们的努力与联合国教科文组织强调的开放科学的四个主要因素联系在一起。

通过在出版创新和技术方面沉淀的十年经验,GigaScience出版社准备推出新的杂志,为其他希望在开放科学的前提下利用专业知识改进出版工作流程的杂志提供一个经济高效的交互式解决方案。