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首页 > 同行 > 2022年03月刊 > 聚焦 > 陈奥 | 2022 时空模考

聚焦

陈奥 | 2022 时空模考作者:

年前参加了汪老师的思维盛宴,我深受激励和鼓舞。作为生化所和时空项目的一员,我最大的想法就是答好组织给的考卷,把iST-5/6D/518工具平台建成世界顶尖的平台,为华大的荣誉而奋斗,为我国生命科学发展做好工具支撑。

知己知彼,为了打赢这场仗,我们对比了国内外时空领域的现状。

2021年华大时空相较主要竞争对手10x Genomics在投入产出比上有一定优势。我们的研发费用远小于对方,但工具性能却是对方的 40,000 倍。但是,我们的碾压性优势是否可以持续呢?

下图是“头部玩家”2022 年的新工具发布计划。无论是一体机、多蛋白联检、空间分辨率,还是FFPE样本,都是今年各大机构的重点发力方向。


简而言之,时空战场形势是严峻的。但是,以时空团队的工程化实力,以华大全流程自主可控的物质基础,我们有能力、有信心完成组织给我们的任务。

1.iST:时空转录组作为时空组学的第一个工具,已经交付了超过 1 万张芯片,工艺越发成熟稳定。今年我们将继续攻关多组学技术,时空蛋白必须要定版可用,原料自主可控,发出中国的声音。表观组继续投入资源探索,力争找到突破口。基于时空芯片的单细胞,完成原理验证,助力 DNBelab C4 打开单细胞应用。时空软件要发布一体化系统,Stereopy、数据库、时空社区等功能要快速迭代。

2.5D、6D:围绕环境互作的工具需求,研发团队正在开发基于 V2 的微生物时空组学技术,争取在同一张芯片上实现原核和真核细胞的时空组学图谱绘制。在脑科学领域上,要探索新的工具,从神经元连接追踪,到脑机接口,力争实现全脑的多模态图谱绘制。

3.518 :除了上述工具研发方向,时空的产业发展重点放在能力建设上。市场、售后等前线模块以培养骨干为主,以科研合作为核心。

时空宣传以学术分享、技术科普、合作需求收集为目标,与集团公传、智造、股份等兄弟部门紧密合作,加速推进华大内外的时空科普宣传工作。

4.全球联合实验室:时空一体机、显微系统、测序仪联动是今年的重中之重。时空一体的原型机已经走通生化流程,与智造团队对接上,预计 2022 年 5 月下线首台样机。显微系统方面,长光团队已经实现了原型机试制,但由于疫情原因,推迟了后续样机部署。期待今年上半年可以定版,下半年实现大量部署。

5.临床病理应用:时空蛋白、FFPE、HE染色、病理算法,是时空病理最核心的诉求,也是今年研发团队必须实现的模块。与此同时,科研合作部门已经搜集到国内外的病理领域专家清单,后续有针对性地开展合作,加速时空与临床的转化过程。在常规病理方面,与智造团队紧密配合,实现从蓝到红的一体化设计布局,在病理工具上实现从 0 到 1 的突破。

以上是我对汪老师主题演讲的理解,以及时空工具方向的资源部署。


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