华大基因拥有数个大型生物信息学超级计算中心,总峰值计算能力达到102T flops,总内存容量达到20TB,总存储能力达到10PB。其中位于深圳和香港的集群的峰值计算能力分列国内生物信息领域第一和第二位,有能力为海量生物信息学数据的存储、处理和分析提供稳定而高效的资源保障。图1所示为华大基因在中国各地所部属的超级计算集群及对应性能。
表1 华大基因现有大型计算集群运算存储能力一览表
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深 圳
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香 港
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北 京
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杭 州
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总 计
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处理器数
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7236
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2400
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300
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64
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10000
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内存容量
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14.5 TB
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4.7TB
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500 GB
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300 GB
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20 TB
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存储容量
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7.08 PB
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2.8PB
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110 TB
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13 TB
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10 PB
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峰值能力
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75 T flops
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25T flops
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1.5 T flops
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0.5 T flops
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102 T flops
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随着基因研究技术进步,生物信息数据的存储计算需求每12到18个月就会增长10倍,远远高于Moore定律提供的参考数值。在生物信息大爆炸的宏观背景下,华大基因对计算硬件资源的投入也在不断攀升。2010年,华大基因第一个超过1 P FLOPS计算能力的超级计算集群将正式投入使用。届时,该集群将成为国内乃至国际生物信息学界新的性能标杆。