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华大基因携手荷兰多家单位建立“数据公开与共享”合作研究新模式
发布日期: 2012-03-23

2012323日,深圳华大基因研究院、荷兰绿色遗传学高技术研究所(Technological Top Institute of Green GeneticsTTIGG)、荷兰eScience中心(Netherlands eScience CentreNLeSC)和荷兰生物信息学研究所(Netherlands Institute of BioinformaticsNBIC)签署合作备忘录,宣布将联合在数据资源管理、基础设施建设等方面开展广泛合作。据协议,该合作团队鼓励建设有利于数据资源公开与共享的设施,并倡议政府和其他合作者积极参与,为实现以“数据资源可持续发展”为目标的国际合作模式而努力。

 

随着基因组学的飞速发展,新一代高通量测序技术已被广泛应用于农业、健康和环境等领域,由此不断涌现的海量数据迫切需要在数据获取、处理、储存、分配等方面进行更多研究。最近,世界经济论坛把基因组数据称为“一种新出现的货币”。全球研究人员亦都深刻认识到只有通过多领域、跨学科的广泛合作,才能使数据资源实现最大可能的合理利用,同时才能更好的避免研究中大量实验和数据的重复,从而节约研究资源,加速科学研究的应用转化。

 

荷兰绿色遗传学高技术研究所主任Bernard de Geus博士说:“海量数据给全球的科学家带来了更多的期望、挑战及合作机会。通过大家紧密的合作,希望能够早日实现基因组数据的可持续利用。”荷兰绿色遗传学高技术研究所由荷兰多家分子育种公司、学校和研究院共同组成。其主要任务是在荷兰知识和教育基地启动研究和教育项目,以求持续创新。

 

“基因组学引发了生命科学领域的一场变革。”深圳华大基因研究院院长汪建指出,“但由此产生的海量生物信息数据将成为未来我们所面临的一个巨大的挑战。华大基因已经深刻认识到这一点,并为此作出了很多努力。我们希望通过这次合作,能够让更多的人认识到‘数据公开与共享’的重要性及价值,同时也希望能有更多的研究人员加入我们。”

 

目前,华大基因已在如何有效解决海量生物信息数据方面进行了大量的研究。如201011月,华大基因和生物医学中心(BioMed Central)共同成立了《GigaScience》杂志,该杂志采用期刊和大型数据库相结合的新型模式,将有助于加速数据的传播和使用,高效促进科学发现进程。在2011年德国致病性大肠杆菌爆发事件中,华大基因及其合作伙伴在第一时间向全球免费公开所有数据,该事件明确地证实了“数据公开及共享”研究模式的重要性。2011年年底,华大基因首台BGI-BOX云计算终端服务器落户中国农业大学,BGI-BOX成为将生物信息分析推广到终端实验室中帮助合作伙伴完成项目的有力工具。

 

荷兰eScience中心由荷兰应用科学研究组织和荷兰SURF基金会联合创办,其目标是通过跨多个学科的大规模的“大数据”分析改变科学实践。荷兰eScience中心主任Jacob de Vlieg博士表示:“此次合作让人感到兴奋和激动,来自中国和荷兰的科学家们将会利用eScience的概念,通过不断的科学发现推动‘大数据’时代的发展。”

 

荷兰生物信息学研究所主要通过对生物研究中所产生的数据、信息和模型进行整合与定量分析,从而实现生命科学研究领域的突破与创新。荷兰生物信息学研究所科学主任Barend Mons博士说:“在组学时代,只要有人进行了生物信息学研究,就需要有人去利用计算机管理所产生的数据。为了能够揭示这些数据中蕴含的信息,则需要更加强大的计算机技术,传统的方法已经无法满足当前的要求,我们应该建立更加广泛的合作来应对这个挑战。”