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全球众多科学家齐聚深圳,共商基因组学未来发展——第六届国际基因组学大会在深圆满落幕
发布日期: 2011-11-16
2011年11月15日,为期3天的“第六届国际基因组学大会(6th International Conference on Genomics)”在深圳大梅沙东部华侨城茵特拉根酒店圆满落幕。本次大会由深圳华大基因研究院(简称华大基因)主办,《GigaScience》杂志、约翰·霍普金斯医学院、遗传工程和生物技术新闻杂志(GEN)协办。来自世界各地的500多位专家学者云集深圳,围绕“DNA测序技术”、“转录组学”、“表观基因组学”和“生物信息学与云计算”等主题,深入探讨了基因组学的发展趋势及其在农业、微生物、生态、人类健康与个体化医疗、合成生物学等领域的研究进展及应用前景。据悉,华大基因举办的国际基因组学大会于每年的11月份召开,已成为国际基因组学领域的学术交流盛会,在国内外颇负盛名。

 

在大会开幕式上,华侨城集团前任副总裁翦迪岸致欢迎辞,他表示非常欢迎各位专家学者能够来到东部华侨城共同探讨基因组学等科学研究,并对华大基因能将这一重要的国际学术大会放到东部华侨城来召开表示衷心感谢,他还表示将与华大基因共商合作机会,将基因组科学与生态旅游相结合,促进大众科普和健康的发展。华大基因主席杨焕明院士总结概述了华大基因近年来在基因组学研究领域所取得的一系列科研成果,他指出,华大基因于2010年至今在《新英格兰医学杂志》 (The New England Journal of Medicine, NEJM)、《自然》(Nature)、《科学》(Science)等国际顶级期刊上已发表29篇文章;此外,杨院士还强调了华大基因的三个重要发展历程:为人类基因组“中国卷”而生(born for 1% HGP);因水稻基因组而名(known by working on rice);和与新一代测序技术并进(grown together with NGS)。

 

随着基因组学研究的不断深入,人类有望揭示生命物质世界的各种前所未知的规律,完全揭开生命之谜,进而驾驶生命,使之为人类的社会经济服务。因此,科学家们提出对地球上不同的生物进行测序,并对它们的基因组解码构建“生命之树”。在大会上华大基因执行院长王俊教授介绍了三个“百万基因组计划”,勾画出了“生命之树”的宏伟蓝图,并邀请各界的科研人士参与该计划。这三个“百万基因组计划”分别为“百万动植物基因组计划”、“百万人基因组计划”和“百万微生态系统基因组计划”。据王教授介绍,在动植物基因组领域,目前华大基因已完成540个物种基因组测序和25,000多个变异基因组研究;在人类基因组研究领域,华大基因已完成38,000多个人相关样本基因组测序研究,其中包含近25,500个复杂疾病样本,4500多个癌症样本;在微生物基因组研究中,华大基因已经完成600多种微生物的基因组测序,共包括3,500多个菌株和1,800多个宏基因组。这次提出的三个“百万基因组计划”旨在破译重要经济和科研价值的动植物基因组,全面了解人类进化及疾病相关的遗传机制,解析所有环境中的微生物群落基因组,最终为促进农业应用、个体健康和生态环境打造坚实的科研基础。

 

目前,遗传学、比较基因组学、高通量生物化学和生物信息学的交织发展,为生物学家提供了一系列先进的“组学”研究工具,极大地推动了临床医学、农业、食品安全、环境与能源等领域的进一步发展。基于测序产生的生物信息数据不仅能够为各领域的基础研究提供遗传学依据,而且对加快测序技术研究成果的转化应用具有十分重要的意义,如利用分子育种提高粮食作物的产量和家畜的生产力及其经济价值;通过找出致病基因揭示致病机理从而改善癌症及其他疾病的诊断、预测和治疗;全面研究整个微生态环境中的微生物群落促进新生物能源的开发和环境的保护等。

 

本次大会邀请到众多国内外各领域的权威专家做特邀报告嘉宾,给大家带来了精彩的报告,如国际人类基因组计划与千人基因组计划的主要负责人之一、英国Sanger 研究所的Richard Durbin博士向大家介绍了“千人基因组计划”和“英国万人基因组计划”的最新研究进展和整体思路。欧洲生物信息研究所Ewan Birney博士介绍了继“人类基因组计划”后最大的国际合作计划之一——“DNA元件百科全书”计划,该计划于2003年9月由美国国立人类基因组研究所启动,其目的是寻求新一代DNA研究技术对人类基因调控序列在全基因组的水平上的应用研究。人类变异组计划协调办公室负责人、墨尔本大学遗传学家Richard Cotton在报告中强调了疾病基因组学研究的重要性,人类变异基因组计划(HVP)的目标是建立相关的“标准、系统和基础设施”以确保世界范围内的临床医生和科学家们能够共享疾病相关的遗传数据用于进行疾病诊断和开展相关研究;此外,华大基因生育健康临床诊断及咨询主管、浙江大学医学院特聘教授祁鸣也阐述了HVP和基因组医学在中国的现状。国际水稻研究所的Kenneth McNally博士向大家介绍了国际水稻基因组研究项目,他指出,基因组辅助选择育种已成为提高作物产量和改善作物品质的重要策略之一,世界人口现已达到70亿,而且还会持续增长,水稻作为一种重要的粮食作物,其产量也应与人口的增长保持一致。在大会上华大基因王俊教授宣布由国际水稻研究所、中国农业科学院和华大基因共同开展的“3000个水稻基因组测序计划”将会扩大为“10,000个水稻基因组测序计划”。

 

此外,《自然-遗传》主编 Myles Axton博士,加拿大麦吉尔大学药理学和治疗学部主任 Moshe Szyf博士,澳大利亚墨尔本大学兽医学院副院长Robin Gasser博士,联合国秘书长高级顾问、全球契约组织高级顾问Frederick C. Dubee博士、哥本哈根大学生物信息中心负责人Anders Krogh博士、日本国立农业生物资源研究所生物信息学中心主任Takeshi Itoh博士、纽西兰植物与食物研究所Sue Gardiner博士、美国约翰·霍普金斯大学医学院Jef Boeke博士、中科院昆明动物研究所教授王文、上海交通大学肿瘤研究所教授朱景德等也在大会上做了精彩的报告,会议现场学术气氛浓厚,讨论热烈。

 

在此次国际基因组学大会期间,华大基因还举办了第二届生物信息学软件发布会,对外发布了其最新版的生物信息学软件,包括最新版SOAP系列软件、遗传变异检测软件、宏基因组测序数据分析软件Metacluster 4.0及两个基于云计算的软件Hecate 2和Gaea 2。此外,在此次发布会上,《GigaScience》杂志还首次对外公布了其大型数据库GigaDB(http://GigaDB.org)及其现已公布可免费访问的17个可引用数据库(http://www.genomics.cn/navigation/show_news.action?newsContent.id=100286)。11月13日,华大基因汪建院长与瑞典卡罗林斯卡医学院Lennart Hammarström教授签署聘书,任命其为华大基因新成立的免疫基因组学中心负责人,并宣布双方将在免疫类疾病等相关领域展开合作研究。11月14日,华大基因与美国约翰·霍普金斯大学签署了《人工合成酵母基因组研究与教育合作协议》,并宣布双方将联合开展人工合成酵母基因组研究,并希望能在人工酿酒酵母基因组的构建方面取得更多的突破。(http://www.genomics.cn/navigation/show_news.action?newsContent.id=100288)