华大基因研究院目前拥有 Illumina/Hiseq2000 Illumina/Hiseq 2500Illumina/Miseq Life Tech/SOLiD4Life Tech/Ion ProtonLife Tech/Ion Torrent PGMRoche/454 GS FLXABI/3730xl等多个测序系统,根据不同的科研需求可选择不同的测序技术。华大基因研究院目前已经具备DNA测序、Small RNA测序、转录组测序、数字化表达谱测序、ChIP-SeqDNA甲基化、目标区域捕获测序、宏基因组测序等研究技术。这些技术集科研、实践和服务应用为一体,覆盖了基因组科学的各个重点研究领域。

组学平台研发与技术转移

DNA测序是生物学研究的基础技术。高通量、高精度的测序技术对生命科学研究、生物医学和临床医疗等领域都具有重要的战略意义。当今测序技术的迅猛发展,出现了多种类型的测序仪。华大基因研究院致力于搭建多平台,实现不同平台的多方向应用。当前致力开展(1Ion Proton平台:台面小型测序仪的代表。采用独特的离子半导体测序芯片,只需几小时即可提供人类基因组、人类外显子组或整个转录组信息。具有快速、灵活的特点。较其它测序技术更快速。读长为100-200 bp。准确性与Ion PGM™ 测序仪相当。(2CG平台:华大基因旗下Complete Genomics自主DNA纳米球测序平台,是目前市面上唯一能达到99.9998%精度的测序系统。其准确率高;数据产出量大;单台机器的通量是同等类型测序系统的10倍以上


                                                             Ion Proton 测序仪

除强大的硬件平台之外,华大基因研究院还有众多自主研发的技术平台:

重要育种实验技术

研发及改进动植物分子育种的实验技术,例如全基因组选择过程中的大规模的DNA快速提取、快速获取标记基因型等。目前这些技术本身并不能满足大规模的需求,需要进一步研发

功能验证

自主开发功能验证平台,引进外部先进技术,对关联分析实验中鉴定出来的大量关联信号进行功能验证,阐释性状分子机制及关联

育种相关统计模型

分子育种过程涉及多种统计模型。在基因型表型关联、个体育种值预测、育种群体选育效率等多个过程中针对不同的情形建立相应的统计模型,实现准确的育种指导

育种数据库

利用自主研发技术,结合网络、编程知识,建立一个实用性强的育种数据库。

干细胞保存和应用

深圳华大基因干细胞平台于2009年成立,主要从事干细胞基础及临床应用研究,并提供干细胞产品服务。

癌症个体化诊疗技术

癌症个体化诊疗是根据癌症患者药物遗传学和药物基因组学特点,采用特异和最佳的化疗药物方案进行化疗的方法。它可以帮助患者选择合适的化疗药物,提高治疗的针对性,最大程度地延长患者的生存期。该平台的开发内容主要包括肿瘤的靶向用药预测、肿瘤个体监控分子标记物筛选、尿沉渣DNA的临床检测技术等,以期应用于临床病人的突变检测和后期治疗监控

肿瘤的低频检测技术

该平台主要研发基于粪便的结肠癌早期诊断技术、尿液的膀胱癌早期诊断技术、外周血循环癌细胞及游离DNA测序技术的开发等。肿瘤的低频检测技术的开发,可为癌症基因组学研究构建新的技术平台,实现癌症研究的新突破

微流控技术

该平台主要研发微流控芯片的设计、加工和制造,为单细胞捕获、核酸提取、核酸反应提供最先进的载体支撑。另外,还承担on chip PCRPoint of Care系统开发等项目

人体共生微生物和健康研究

以人体共生微生物为研究对象,研究人体共生微生物以及共生微生物和人的健康之间的关系。在未来的1-3年时间内,华大基因研究院计划将多组学贯穿研究平台引进人体共生微生物实验室。结合微生物测序生产、信息分析、微生物筛选以及微生物功能验证等,逐步研究和揭示人体肠道微生物和疾病的关系、人体肠道微生物和饮食的关系、人体肠道微生物和宿主代谢、基因型之间的关系

蛋白质组学研究

该平台的研究方向主要包括蛋白质鉴定、定量、修饰、互作等。目前主要进行蛋白质组学相关核心软件及算法的开发以及相关实验技术的开发及应用。正在进行的项目有蛋白质组基因组学研究、肿瘤基因组-转录组-蛋白质组贯穿研究、蛋白质综合鉴定系统开发等

代谢组学研究

代谢组学研究是继基因组学和蛋白质组学之后新发展起来的学科,通过对生物体内相对分子质量1000Da以内的小分子代谢物进行定性定量分析,寻找代谢物与生理病理变化的关系。该平台旨在开展个体化代谢组学研究,为生命的营养状态、健康水平、疾病诊断与治疗提供个体化指导