GigaScience是一个崭新的开放型在线期刊于2012年7月12日创刊GigaScience采用标准全文文献、数据库信息以及信息分析工具相结合的崭新模式,来发表大规模的生物学研究成果,使读者不仅可以着眼于文献中所得到的科学结论,还可直接通过文献所提供的数据和分析工具对结果进行测试和验证,实现了数据的透明、公开及可重现性。其数据库GigaDB(http://GigaDB.org)已采用数字对象唯一标识符(DOIs)对杂志数据库中的所有数据进行标识,使数据保存更加永久,实现可追踪、可检索、可链接、可引用,而之前这些功能仅能用于学术文献。

创刊一周年时GigaDB存储50多个数据集,数据量达25TB其中,华大基因很多未发表的数据集都先在该平台上进行发布,以供其他项目使用,这并未影响到日后文章的发表,例如鸽子基因组数据首先于2011年7月在GigaScience公布,随后其文章于2013年2月在《科学》杂志上发表,而从数据公布到文章发表期间,其他的科研工作者可不受限制的使用基因组数据,且发布了与鸽乳相关基因的研究;北极熊基因组在GigaScience发布后,有几个研究组也使用了已经布但未发表文章的北极熊基因组数据,用于几个熊属物种的比较基因组和群体遗传学研究。

2013年,GigaDB数据库进行改版,以崭新的面孔、全新的功能及浏览选项进行了重新发布,并可提供比FTP传输速度快100倍的Aspera数据传输。另外,GigaScience新开发的数据分析平台GigaGalaxy为共享计算工具和流程提供了一种全新的途径,可以更好地支持数据分析的可重现性。

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